Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mmp9P41245 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Mmp9P41245 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
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