Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtbP41155 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtbP41155 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtbP41155 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtbP41155 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtbP41155 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtbP41155 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtbP41155 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtbP41155 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtbP41155 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtbP41155 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtbP41155 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LtbP41155 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtbP41155 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtbP41155 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtbP41155 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtbP41155 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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LtbP41155 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtbP41155 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtbP41155 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtbP41155 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtbP41155 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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LtbP41155 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtbP41155 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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LtbP41155 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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LtbP41155 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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LtbP41155 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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LtbP41155 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtbP41155 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LtbP41155 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtbP41155 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtbP41155 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LtbP41155 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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