Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Rpl28P41105 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
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