Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lig1P37913 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lig1P37913 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lig1P37913 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lig1P37913 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lig1P37913 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lig1P37913 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lig1P37913 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Lig1P37913 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Lig1P37913 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lig1P37913 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lig1P37913 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Lig1P37913 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Lig1P37913 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms