Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Gm12666-201ENSMUST00000123179 764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ly6dP35459 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ly6dP35459 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ly6dP35459 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ly6dP35459 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms