Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Saa4P31532 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.92
Saa4P31532 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Saa4P31532 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms