Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cd28P31041 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cd28P31041 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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