Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Psmb9P28076 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Psmb9P28076 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms