Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

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Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PdgfraP26618 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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