Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TP20293 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TP20293 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TP20293 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TP20293 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TP20293 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TP20293 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TP20293 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TP20293 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TP20293 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TP20293 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TP20293 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TP20293 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TP20293 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TP20293 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TP20293 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TP20293 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TP20293 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TP20293 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TP20293 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TP20293 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TP20293 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TP20293 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TP20293 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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TP20293 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TP20293 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TP20293 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TP20293 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TP20293 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TP20293 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TP20293 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TP20293 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TP20293 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TP20293 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TP20293 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TP20293 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TP20293 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TP20293 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TP20293 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TP20293 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TP20293 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TP20293 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TP20293 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TP20293 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TP20293 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TP20293 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TP20293 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TP20293 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TP20293 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TP20293 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TP20293 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TP20293 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TP20293 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TP20293 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TP20293 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TP20293 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TP20293 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TP20293 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TP20293 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TP20293 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TP20293 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TP20293 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TP20293 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TP20293 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TP20293 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TP20293 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TP20293 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TP20293 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TP20293 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TP20293 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TP20293 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TP20293 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TP20293 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TP20293 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TP20293 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TP20293 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TP20293 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TP20293 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TP20293 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TP20293 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TP20293 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TP20293 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TP20293 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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