Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pou5f1P20263 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pou5f1P20263 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms