Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
P20040 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
P20040 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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