Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18529 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18529 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18529 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18529 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18529 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18529 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18529 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18529 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18529 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18529 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P18529 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18529 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18529 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18529 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18529 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18529 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P18529 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18529 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18529 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18529 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18529 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18529 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18529 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18529 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18529 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P18529 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
P18529 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P18529 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P18529 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms