Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Spi1P17433 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Spi1P17433 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Spi1P17433 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Spi1P17433 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Spi1P17433 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Spi1P17433 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Spi1P17433 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Spi1P17433 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Spi1P17433 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Spi1P17433 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Spi1P17433 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Spi1P17433 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Spi1P17433 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Spi1P17433 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Spi1P17433 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
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Spi1P17433 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Spi1P17433 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Spi1P17433 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Spi1P17433 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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