Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Sptan1P16546 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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