Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Nr4a1P12813 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.8 ms