Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Calb1P12658 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Calb1P12658 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb1P12658 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Calb1P12658 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Calb1P12658 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Calb1P12658 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms