Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Rnf165-201ENSMUST00000026494 7300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Defa1P11477 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms