Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccl2P10148 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl2P10148 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms