Protein–RNA interactions for Protein: P09092

Hoxa6, Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6P09092 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hoxa6P09092 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hoxa6P09092 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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