Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tgfb1P04202 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms