Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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H2-Ab1P01921 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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H2-Ab1P01921 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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H2-Ab1P01921 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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H2-Ab1P01921 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Ab1P01921 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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H2-Ab1P01921 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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