Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tcn2O88968 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms