Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cfdp1O88271 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms