Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp100O35892 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp100O35892 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp100O35892 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sp100O35892 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Sp100O35892 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Sp100O35892 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sp100O35892 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms