Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Atf6bO35451 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Atf6bO35451 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Atf6bO35451 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Atf6bO35451 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Atf6bO35451 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Atf6bO35451 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Atf6bO35451 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Atf6bO35451 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Atf6bO35451 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atf6bO35451 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Atf6bO35451 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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Atf6bO35451 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
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Atf6bO35451 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Atf6bO35451 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Atf6bO35451 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Atf6bO35451 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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