Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Casq1O09165 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Casq1O09165 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Casq1O09165 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Casq1O09165 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Casq1O09165 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Casq1O09165 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casq1O09165 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Casq1O09165 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casq1O09165 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq1O09165 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq1O09165 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Casq1O09165 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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