Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Gm2056J3QQ02 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Gm2056J3QQ02 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
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Gm2056J3QQ02 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Gm2056J3QQ02 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm2056J3QQ02 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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