Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm8888J3QPX5 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm8888J3QPX5 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm8888J3QPX5 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm8888J3QPX5 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm8888J3QPX5 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm8888J3QPX5 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm8888J3QPX5 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm8888J3QPX5 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm8888J3QPX5 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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