Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3415J3QMS8 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3415J3QMS8 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms