Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm6594J3QM43 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm6594J3QM43 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.1 ms