Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn20G5E8X0 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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