Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fndc1E9Q043 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Fndc1E9Q043 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms