Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc175E9PVB3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms