Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rdh8D3Z6W3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rdh8D3Z6W3 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rdh8D3Z6W3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rdh8D3Z6W3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rdh8D3Z6W3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rdh8D3Z6W3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rdh8D3Z6W3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rdh8D3Z6W3 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rdh8D3Z6W3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rdh8D3Z6W3 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rdh8D3Z6W3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rdh8D3Z6W3 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rdh8D3Z6W3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rdh8D3Z6W3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rdh8D3Z6W3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rdh8D3Z6W3 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rdh8D3Z6W3 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rdh8D3Z6W3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms