Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Erbb4-202ENSMUST00000121473 12037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Svil-203ENSMUST00000126977 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Vpreb3D3Z6J4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms