Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc6D3YZP9 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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