Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rnf217D3YYI7 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rnf217D3YYI7 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rnf217D3YYI7 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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