Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmf1B9EKI3 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmf1B9EKI3 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmf1B9EKI3 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmf1B9EKI3 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmf1B9EKI3 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmf1B9EKI3 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmf1B9EKI3 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmf1B9EKI3 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmf1B9EKI3 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmf1B9EKI3 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms