Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
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Rd3lB2RV38 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Rd3lB2RV38 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Rd3lB2RV38 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Rd3lB2RV38 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Rd3lB2RV38 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Rd3lB2RV38 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Rd3lB2RV38 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Rd3lB2RV38 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Rd3lB2RV38 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Rd3lB2RV38 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Rd3lB2RV38 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Rd3lB2RV38 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rd3lB2RV38 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
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