Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brpf1B2RRD7 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Brpf1B2RRD7 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms