Protein–RNA interactions for Protein: A2ASQ1

Agrn, Agrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrnA2ASQ1 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
AgrnA2ASQ1 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
AgrnA2ASQ1 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AgrnA2ASQ1 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
AgrnA2ASQ1 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
AgrnA2ASQ1 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AgrnA2ASQ1 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
AgrnA2ASQ1 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
AgrnA2ASQ1 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
AgrnA2ASQ1 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
AgrnA2ASQ1 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AgrnA2ASQ1 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
AgrnA2ASQ1 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AgrnA2ASQ1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
AgrnA2ASQ1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AgrnA2ASQ1 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AgrnA2ASQ1 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AgrnA2ASQ1 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AgrnA2ASQ1 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AgrnA2ASQ1 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
AgrnA2ASQ1 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AgrnA2ASQ1 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AgrnA2ASQ1 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AgrnA2ASQ1 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AgrnA2ASQ1 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
AgrnA2ASQ1 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AgrnA2ASQ1 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AgrnA2ASQ1 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AgrnA2ASQ1 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
AgrnA2ASQ1 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
AgrnA2ASQ1 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
AgrnA2ASQ1 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
AgrnA2ASQ1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
AgrnA2ASQ1 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
AgrnA2ASQ1 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
AgrnA2ASQ1 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
AgrnA2ASQ1 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
AgrnA2ASQ1 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
AgrnA2ASQ1 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
AgrnA2ASQ1 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
AgrnA2ASQ1 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
AgrnA2ASQ1 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
AgrnA2ASQ1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
AgrnA2ASQ1 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms