Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Rtf1A2AQ19 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Rtf1A2AQ19 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rtf1A2AQ19 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rtf1A2AQ19 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rtf1A2AQ19 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rtf1A2AQ19 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rtf1A2AQ19 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rtf1A2AQ19 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms