Protein–RNA interactions for Protein: A2ALV5

AI481877, Expressed sequence AI481877, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AI481877A2ALV5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
AI481877A2ALV5 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AI481877A2ALV5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AI481877A2ALV5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AI481877A2ALV5 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AI481877A2ALV5 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AI481877A2ALV5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AI481877A2ALV5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AI481877A2ALV5 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AI481877A2ALV5 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AI481877A2ALV5 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
AI481877A2ALV5 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AI481877A2ALV5 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AI481877A2ALV5 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AI481877A2ALV5 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AI481877A2ALV5 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AI481877A2ALV5 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AI481877A2ALV5 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AI481877A2ALV5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AI481877A2ALV5 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms