Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pramef6A2A8M8 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Pramef6A2A8M8 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.7 ms