Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calcoco2A2A6M5 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calcoco2A2A6M5 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calcoco2A2A6M5 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calcoco2A2A6M5 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Calcoco2A2A6M5 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Calcoco2A2A6M5 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calcoco2A2A6M5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Calcoco2A2A6M5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calcoco2A2A6M5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calcoco2A2A6M5 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Calcoco2A2A6M5 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calcoco2A2A6M5 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calcoco2A2A6M5 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calcoco2A2A6M5 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calcoco2A2A6M5 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calcoco2A2A6M5 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calcoco2A2A6M5 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calcoco2A2A6M5 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calcoco2A2A6M5 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calcoco2A2A6M5 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Calcoco2A2A6M5 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calcoco2A2A6M5 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calcoco2A2A6M5 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calcoco2A2A6M5 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Calcoco2A2A6M5 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Calcoco2A2A6M5 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms