Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Krt27Q9Z320 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Krt27Q9Z320 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms