Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CcniQ9Z2V9 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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