Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ubl3Q9Z2M6 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms