Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Uso1Q9Z1Z0 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms